章太炎精于《伤寒论》文献研究及理论研究，他的研究成果至今犹有重大价值。1994年上海人民出版社出版《章太炎全集》，2016年重加编写再次出版，内有多篇《伤寒论》文献考据论文。

章太炎以《宋版伤寒论[文]》为依据，将王叔和注[章]语寻出，不仅确证王叔[来]和绝未改窜经文，而且[自]确证宋本《伤寒论》正[证]文中有许多王叔和注语[书]。这是一个前无古人的[报]发掘工作。此前，人们[名]读的多是成无己《注解[中]伤寒论》，而成无己对[心]《伤寒论》正文中包含[文]王叔和注语不曾知晓。[章]读赵开美白文本《伤寒[来]论》者，对正文中的王[自]叔和注，亦无所考、无[证]所知。章太炎对王叔和[书]注语的揭示与分析有重[报]大意义。下引章太炎《[名]论〈伤寒论〉原本及注[中]家优劣》之文：

明赵清常所刻《伤寒论[心]》有二：一单论本，为[文]林亿等校定者；一为论[章]注本，即成无己所注者[来]。单论本方下时有叔和[自]按语（大字者，叔和按[证]语也；夹注者，林亿校[书]语也）而成注本多删之[报]。如云：

“疑非仲景方、疑非仲[名]景意”者，凡得四条：[中]

1*芍药甘草附子汤方[心]下云：疑非仲景方（6[文]8条）；

2*黄连汤方下云：疑[章]非仲景方（173条）[来]；

3*蜜煎方下云：疑非[自]仲景意，已试甚良（2[证]33条）；

4*小青龙汤方下云：[书]荛花不治利，麻黄主喘[报]，今此语反之，疑非仲[名]景意（39条）。

亦有明源流，较同异者[中]，凡得七条：

1*柴胡桂枝汤方下云[心]：本云人参汤，作如桂[文]枝法，加半夏、柴胡、[章]黄芩，复如柴胡法，今[来]用人参作半剂（146[自]条）；

2*生姜泻心汤方下云[证]：附子泻心汤，本云加[书]附子。半夏泻心汤、甘[报]草泻心汤，同体别名耳[名]。生姜泻心汤，本云理[中]中人参黄芩汤，去桂枝[心]、朮，加黄连，并泻肝[文]法（157条）；

3*大柴胡汤方下云：[章]一方加大黄二两，若不[来]加，恐不为大柴胡汤（[自]103条）；

4*麻黄杏子甘草石膏[证]汤方下云：温服一升，[书]本云黄耳杯（63条）[报]；

5*去桂加白术汤方下[名]云：附子三枚，恐多也[中]。虚弱家及产妇减服之[心]（174条）；

6*桂枝二麻黄一汤方[文]下云：本云：桂枝汤二[章]分，麻黄汤一分，合为[来]二升，分再服，今合为[自]一方（25条）；

7*桂枝二越婢一汤方[证]下云：本云当裁为越婢[书]汤、桂枝汤，合之饮一[报]升；今合为一方，桂枝[名]汤二分，越婢汤一分（[中]27条）。

这是章太炎从宋本《伤[心]寒论》发掘出来的王叔[文]和按语。章太炎通过精[章]心研考，发现宋本《伤[来]寒论》正文中包含王叔[自]和之语，实为突破性的[证]研究成果。章太炎读书[书]心细如发，目光如电，[报]罅漏毕照，所以才有这[名]样的成就。下面是章太[中]炎对上述材料的分析判[心]断：

其称“本云”者，是仲[文]景原本如此。其云“疑[章]者”，则不敢加以臆断[来]。此等成本多删去之，[自]唯存芍药甘草附子汤、[证]大柴胡汤、麻黄杏子甘[书]草石膏汤、桂枝二越婢[报]一汤方下四事尔。假令[名]王叔和改窜仲景真本，[中]疑者当直削其方。有大[心]黄无大黄者，当以己意[文]裁定，焉用彷徨顾却为[章]也？王叔和于真本有所[来]改易者，唯是方名，如[自]上所举生姜泻心汤等；[证]有所改编者，唯痉湿暍[书]一篇。其文曰：“伤寒[报]所致太阳痉湿暍三种，[名]宜应别论，以为与伤寒[中]相似，故此见之。”此[心]则痉湿暍等本在太阳篇[文]中，王叔和乃别次于太[章]阳篇外。详此诸证，即[来]知王叔和搜集仲景遗文[自]，施以编次，其矜慎也[证]如此，犹可以改窜诬之[书]耶？

章太炎云：“本云者，是仲景原本如此”，许多读者对“本云”缺乏正确理解，章太炎予以正确解释。