开一家营养早餐店需要办理的证件和手续主要包括以下几个方面：

1、营业执照：首先需要向当地工商行政管理部门申请办理营业执照，这是经营餐饮业务的基本凭证，在申请过程中，需要提供一定的个人信息、店铺地址、经营范围等资料，经过审核后方可获得营业执照。

2、食品经营许可证：为了确保食品安全，营养早餐店在开业前还需要向当地卫生行政部门申请办理食品经营许可证，在申请过程中，需要提供食品原料采购渠道、卫生设施、从业人员健康证明等相关资料，经过现场检查和审核后方可获得食品经营许可证。

3、消防安全证：营养早餐店属于人员密集场所，消防安全至关重要，开业前需要向当地消防部门申请办理消防安全证，在申请过程中，需要提供店铺平面图、消防设施设备清单、消防演练记录等相关资料，经过消防安全检查和验收后方可获得消防安全证。

4、税务登记证：营养早餐店在取得营业执照后，还需要向当地税务部门申请办理税务登记证，在申请过程中，需要提供营业执照、银行开户许可证等相关资料，经过审核后方可获得税务登记证。

5、社保登记证：为了保障员工的合法权益，营养早餐店需要为员工缴纳社会保险，在开业前需要向当地社保部门申请办理社保登记证，在申请过程中，需要提供营业执照、劳动合同等相关资料，经过审核后方可获得社保登记证。

6、劳动合同：营养早餐店在招聘员工时，需要与员工签订劳动合同，劳动合同是双方约定劳动关系、权利义务的重要凭证，应当遵循国家的相关法律法规，明确双方的岗位职责、工作时间、工资待遇等内容。

7、培训合格证：根据《食品安全法》的规定，从事食品生产经营活动的人员需要接受食品安全培训，营养早餐店在开业前，应当组织员工参加食品安全培训并取得培训合格证，培训合格证是证明员工具备食品安全知识的重要凭证。

8、其他相关证件：根据当地的具体规定，营养早餐店可能还需要办理其他相关证件，如环保许可证、公共卫生许可证等，具体需要办理哪些证件，可以咨询当地的工商行政管理、卫生行政部门等相关部门。

开一家营养早餐店需要办理的证件和手续较多，涉及到食品安全、消防安全、税收等方面，在开业前，应当认真了解和准备相关手续，确保合法合规经营，还应当注重提高服务质量，为顾客提供美味、健康的营养早餐。