卫生部的中医针灸师证考哪些科目的内容，需要根据不同的考试标准和要求而定，中医针灸师证考试主要包括以下几个方面：

1、中医基础理论知识：包括中医基本理论、中药学、方剂学、中医诊断学等方面的知识，这些知识是中医针灸师必须掌握的基础，也是进行临床实践的前提。

2、针灸技术操作：包括针刺法、灸法、拔罐法、刮痧法等常用的针灸技术操作方法，考生需要熟练掌握各种技术的要领和操作流程，并能够根据病情进行选择和应用。

3、临床诊断与治疗：包括常见病、多发病的诊断和治疗方法，以及一些特殊疾病的诊断和治疗方法，考生需要具备一定的临床经验和实践能力，能够在实际工作中灵活运用所学知识。

4、法律法规和职业道德：包括相关的法律法规和职业道德规范，如《中华人民共和国中医药法》、《中华人民共和国医师法》等，考生需要了解相关法律法规的内容，并遵守职业道德规范，保证医疗安全和质量。

5、科学研究与创新能力：包括科学研究的方法和技巧，以及创新思维和能力的培养，考生需要具备一定的科学研究能力和创新意识，能够在实践中不断探索和发展新的针灸技术和方法。

卫生部的中医针灸师证考试是一个综合性较强的考试项目，需要考生具备扎实的理论基础、熟练的操作技能、丰富的临床经验、良好的职业道德素养以及一定的科学研究能力和创新意识，只有全面掌握这些知识和技能，才能够成为一名合格的中医针灸师。